W samo południe w sanktuarium św. Jana Pawła II na Białych Morzach rozpoczęła się Msza św., której przewodniczył bp Damian Muskus. Po niej uczestnicy ustawili się do zbiorowego zdjęcia dla Ojca Świętego Franciszka.
Mszy św., która rozpoczęła się o godz. 12, przewodniczył bp Tadeusz Pieronek, a kazanie wygłosił ks. Adam Boniecki. W uroczystościach brał udział także ks. Wojciech Lemański. Suspendowany kapłan w trakcie Mszy św. odczytał fragment Księgi Koheleta.
Po panującym do południa upale uczestnicy ŚDM musieli się zmierzyć z ulewnym deszczem. Z pomocą przyszły niebieskie, czerwone i żółte (to kolory ŚDM Kraków 2016) peleryny z pakietów pielgrzyma.
31 lipca po południu rozpoczął się powrót pielgrzymów ŚDM do domów. Nie sprzyjały im warunki atmosferyczne. Nad centrum Krakowa, także w okolicach Dworca Głównego PKP, lał deszcz i biły pioruny.