Generał zakonu jezuitów o. Arturo Marcelino Sosa Abascal stwierdził, że o. Rupnik "przekroczył dopuszczalne granice relacji między dorosłymi" około trzydziestu lat temu w kontaktach z kobietą, której był kierownikiem duchowym. Ponieważ również ją spowiadał, automatycznie popadł w karę ekskomuniki. Została ona zdjęta przez Stolicę Apostolską w 2019 roku, ponieważ wyraził skruchę. Sprawą zajmowała się Dykasteria Nauki Wiary. Zakon jezuitów nałożył natomiast na o. Rupnika sankcje, o których pisaliśmy wcześniej. Chodzi o zakaz spowiadania, kierownictwa duchowego i prowadzenia Ćwiczeń duchowych. Ponadto zabroniono mu angażowania się w działalność publiczną bez zgody przełożonego lokalnego.

68-letni dziś o. Rupnik jest twórcą mozaik sakralnych. Był m.in. odpowiedzialny za artystyczną renowację kaplicy Redemptoris Mater w watykańskim Pałacu Apostolskim. To mistrzowskie dzieło biblijnych mozaik pokrywających ściany i sufit przyniosło mu sławę. Zajmował szereg odpowiedzialnych funkcji naukowych, a także w organach Stolicy Apostolskiej.

UWAGA: Powyższy tekst był edytowany po stwierdzeniu stwierdzenia nieścisłości i braku we wcześniejszej wersji, pochodzącej z PAP. Chodzi o fakt automatycznego popadnięcia o Rupnika w karę ekskomuniki w momencie dokonania przestępstwa oraz zdjęcie tejże ekskomuniki w roku 2019.