Ks. prof. Władysław Zuziak, rektor uczelni, przypomniał, że Akademia powstawała w trudnych dla Polaków czasach. W zaledwie pięć dni po jej powołaniu wprowadzono w Polsce stan wojenny. „Jaką odwagę a zarazem wiarę i myślenie przyszłościowe mieli Jana Paweł II i ówczesny Wielki Kanclerz ks. kard. Franciszek Macharski, że doszło do powstania Papieskiej Akademii Teologicznej. I to dzieło wciąż się rozwijało dzięki wytrwałej pracy, a nawet determinacji wszystkich profesorów i studentów” – powiedział ks. prof. Zuziak.

W 2009 r. Benedykt XVI przekształcił uczelnię w Uniwersytet Papieski Jana Pawła II. Obecnie kształci się tam 3,6 tys. studentów.